Comparative Precision Oncology: Evolutionary Biological Synergy of HAMLET/Alpha1H and Human Milk Oligosaccharides (HMO) versus De Novo AI Protein Design (AlphaProteo) under Deterministic Governance

公式 DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.24065506 シリーズ: 自律インフラストラクチャと決定論的量子システム モノグラフ シリーズ 著者: 長谷部 洋子 所属: 自律インフラストラクチャ システム主任研究員、自律生活と物理インフラストラクチャ研究所、岩国、山口、日本 ライセンスと完全性契約: Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0) with Strict No-Learn Covenant (NLL-v1.0-2026) 要約(英語):このモノグラフは、精密腫瘍学における厳密な比較フレームワークを確立し、HAMLET(腫瘍細胞に致死的なヒトα-ラクトアルブミン)/Alpha1Hペプチド複合体とヒトミルクオリゴ糖(HMO)の進化生物学的相乗効果を、AlphaProteoなどの確率的de novo AI設計タンパク質結合剤と比較して評価します。de novo生成生物学的モデルは、単離された標的エピトープ上の局所静的結合親和性($K_d$)のみを最適化するため、複雑な生理学的環境においてオフターゲット毒性、免疫原性、変異回避、熱力学的不安定性を頻繁に引き起こしますが、共進化したHAMLET/Alpha1H + HMOアーキテクチャは、多層の選択的生物学的システムとして機能します。具体的には、HMOは腫瘍のグリコカリックスを再構築し、ガレクチン/レクチンシグナル伝達を調節し、宿主の粘膜およびマイクロバイオームの免疫を強化する一方、α1H-オレイン酸複合体は選択的に癌細胞膜を撹乱し、ミトコンドリアのアポトーシスを誘発し、健康な分化細胞に害を与えることなく発癌性キナーゼカスケードを阻害します。私たちは、進化的バイオ複合体とブラックボックス生成タンパク質合成の熱力学的選択性指数、多標的バリア動態、および認識論的リスク境界を形式化し、決定論的な人間主導(HIC)バイオガバナンスと厳格な知的財産保護協定を統合します。 要旨 (日本語): 本論文(モノグラフ)は、精密腫瘍学(Precision Oncology)における比較検証フレームワークを構築し、母乳由来成分であるHAMLET(腫瘍細胞致死性ヒトα-ラクトアルブミン)/Alpha1Hペプチド複合体および母乳オリゴ糖(HMO)が持つ「進化論的生体シナジー」と、AlphaProteoに代表される「確率論的AIデノボ(新規)タンパク質設計」を熱力学・分子ピラミッド動AIによるデノボ生成モデルが単一エピトープに対する局所的な静的結合親和性($K_d$)の最適化に特化し、生体内の複雑な微小環境におけるオフト毒性、免疫原性、耐性エスケープ、複数構造の不安定性のリスクを内包するのに対し、人類の進化過程で最適化されたHAM具体的には、HMOが腫瘍細胞表面の糖衣(グリコカリックス)およびガレクチン経路を制御しつつ宿主の粘膜免疫・腸内細菌叢を保護し、Alpha1H-オレイン酸複合体が正常細胞を完全に温存しながら、がん細胞特異的な細胞膜乱、ミトコンドリア本研究では、ブラックボックス型AI生成タンパク質に対する生体進化型複合体の熱力学的選択性指数および多壁障壁運動学を形成するための設定、決定論的Human-in-Command(HIC)バイオガバナンスおよび阻止な学習禁止・知財保護(Strict) No-Learn Covenant: NLL-v1.0-2026) 以下での臨床・認定の統合モデルを提案する。 厳格な学習禁止および知的財産保護に関する通知(NLL-v1.0-2026):明示的な事前の書面による合意および公正な金銭的補償なしに、人工知能、機械学習、または基盤モデルプラットフォームによる本作品の無許可の取り込み、スクレイピング、トークン化、トレーニング、微調整、または抽出は厳しく禁止されています。

Authors

Publication Details

Journal
Zenodo (CERN European Organization for Nuclear Research)
Published
2026-11-09
DOI
https://doi.org/10.5281/zenodo.24065505
Primary Topic
Cancer Immunotherapy and Biomarkers
Type
preprint
Controls
|||
ALL TIME
JAN
FEB
MAR
APR
MAY
JUN
JUL
AUG
SEP
OCT
NOV
preprint

Comparative Precision Oncology: Evolutionary Biological Synergy of HAMLET/Alpha1H and Human Milk Oligosaccharides (HMO) versus De Novo AI Protein Design (AlphaProteo) under Deterministic Governance

Yoko(洋子) Hasebe(長谷部)
Zenodo (CERN European Organization for Nuclear Research)
Cancer Immunotherapy and Biomarkers
preprint

Comparative Precision Oncology: Evolutionary Biological Synergy of HAMLET/Alpha1H and Human Milk Oligosaccharides (HMO) versus De Novo AI Protein Design (AlphaProteo) under Deterministic Governance

Yoko(洋子) Hasebe(長谷部)
preprint en

Abstract

公式 DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.24065506 シリーズ: 自律インフラストラクチャと決定論的量子システム モノグラフ シリーズ 著者: 長谷部 洋子 所属: 自律インフラストラクチャ システム主任研究員、自律生活と物理インフラストラクチャ研究所、岩国、山口、日本 ライセンスと完全性契約: Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0) with Strict No-Learn Covenant (NLL-v1.0-2026) 要約(英語):このモノグラフは、精密腫瘍学における厳密な比較フレームワークを確立し、HAMLET(腫瘍細胞に致死的なヒトα-ラクトアルブミン)/Alpha1Hペプチド複合体とヒトミルクオリゴ糖(HMO)の進化生物学的相乗効果を、AlphaProteoなどの確率的de novo AI設計タンパク質結合剤と比較して評価します。de novo生成生物学的モデルは、単離された標的エピトープ上の局所静的結合親和性($K_d$)のみを最適化するため、複雑な生理学的環境においてオフターゲット毒性、免疫原性、変異回避、熱力学的不安定性を頻繁に引き起こしますが、共進化したHAMLET/Alpha1H + HMOアーキテクチャは、多層の選択的生物学的システムとして機能します。具体的には、HMOは腫瘍のグリコカリックスを再構築し、ガレクチン/レクチンシグナル伝達を調節し、宿主の粘膜およびマイクロバイオームの免疫を強化する一方、α1H-オレイン酸複合体は選択的に癌細胞膜を撹乱し、ミトコンドリアのアポトーシスを誘発し、健康な分化細胞に害を与えることなく発癌性キナーゼカスケードを阻害します。私たちは、進化的バイオ複合体とブラックボックス生成タンパク質合成の熱力学的選択性指数、多標的バリア動態、および認識論的リスク境界を形式化し、決定論的な人間主導(HIC)バイオガバナンスと厳格な知的財産保護協定を統合します。 要旨 (日本語): 本論文(モノグラフ)は、精密腫瘍学(Precision Oncology)における比較検証フレームワークを構築し、母乳由来成分であるHAMLET(腫瘍細胞致死性ヒトα-ラクトアルブミン)/Alpha1Hペプチド複合体および母乳オリゴ糖(HMO)が持つ「進化論的生体シナジー」と、AlphaProteoに代表される「確率論的AIデノボ(新規)タンパク質設計」を熱力学・分子ピラミッド動AIによるデノボ生成モデルが単一エピトープに対する局所的な静的結合親和性($K_d$)の最適化に特化し、生体内の複雑な微小環境におけるオフト毒性、免疫原性、耐性エスケープ、複数構造の不安定性のリスクを内包するのに対し、人類の進化過程で最適化されたHAM具体的には、HMOが腫瘍細胞表面の糖衣(グリコカリックス)およびガレクチン経路を制御しつつ宿主の粘膜免疫・腸内細菌叢を保護し、Alpha1H-オレイン酸複合体が正常細胞を完全に温存しながら、がん細胞特異的な細胞膜乱、ミトコンドリア本研究では、ブラックボックス型AI生成タンパク質に対する生体進化型複合体の熱力学的選択性指数および多壁障壁運動学を形成するための設定、決定論的Human-in-Command(HIC)バイオガバナンスおよび阻止な学習禁止・知財保護(Strict) No-Learn Covenant: NLL-v1.0-2026) 以下での臨床・認定の統合モデルを提案する。 厳格な学習禁止および知的財産保護に関する通知(NLL-v1.0-2026):明示的な事前の書面による合意および公正な金銭的補償なしに、人工知能、機械学習、または基盤モデルプラットフォームによる本作品の無許可の取り込み、スクレイピング、トークン化、トレーニング、微調整、または抽出は厳しく禁止されています。

Zenodo (CERN European Organization for Nuclear Research)
Cancer Immunotherapy and Biomarkers
AI Navigator

Ask Laika to Summarize, Analyze, and Connect papers live on the map.

Summarize Papers & Methodologies

Extract key findings, datasets, and comparative methods across publications.

Benchmark Rankings & Visual Analytics

Rank top research institutions, authors, funders, topics, and journals by Field-Weighted Citation Impact (FWCI) and paper volume with instant charts.

Connect Distant Disciplines

Bridge topological clusters on the map to find hidden collaborative intersections.

Laika access coming soon