Возраст-ассоциированные изменения характеристик свободно циркулирующей ДНК: полногеномный анализ

Фрагменты свободно циркулирующей ДНК (сцДНК), обнаруживаемые в плазме крови, образуются в результате деградации геномной ДНК в ходе клеточной гибели. Настоящая работа является первым исследованием возраст-ассоциированной изменчивости характеристик сцДНК в образцах условно-здоровых людей из российской популяции. Проведенный анализ демонстрирует, что по мере старения организма происходят изменения характеристик сцДНК, которые наблюдаются по всему геному. На многих геномных интервалах обнаружены возраст-ассоциированные изменения количества и распределения длин образующихся фрагментов сцДНК. В настоящей работе мы идентифицировали геномные интервалы, в пределах которых заметны наиболее выраженные возраст-ассоциированные изменения количества фрагментов сцДНК. С использованием биоинформатических инструментов на этих интервалах выявлены белок-кодирующие гены. С помощью портала DISEASES и веб-инструмента voyAGEr для каждого гена получены сведения относительно его тканеспецифической возраст-ассоциированной экспрессии, связанной также с определенными состояниями и патологиями. Выявлены несколько закономерностей, указывающих на возможные взаимосвязи фрагментации ДНК и изменений уровня экспрессии генов.