Statistical Architecture in the Voynich Manuscript: A Phonetically Agnostic Structural Analysis

English Voynich Manuscript Statistical Structure Analysis: Phonetically Agnostic Structural Analysis (PASA) — Chapters 1–17 Ren Kagawa / 架川 蓮 (ArchiFlow AI) · 2026 Analysis engine: Claude Sonnet 4.6 (Anthropic) + Codex (OpenAI) independent verification Corpus: ZL3b ver_53 (37,394 tokens, 227 folios, Yale Beinecke MS 408, c. 1404–1438) This series presents a phonetically agnostic structural analysis of the Voynich Manuscript. No phonetic values are assigned to any EVA character at any point across all seventeen chapters. The central question is not "what sounds do the characters represent?" but "what structural and semantic organisation can be established from distributional statistics alone?" The single most important finding across Chapters 1–17: The manuscript encodes a coherent intellectual framework — scholastic medical cosmology (Speculativa Medicina) of the Bologna-Padua tradition (c. 1310–1420) — using vocabulary borrowed from natural languages (Latin, Arabic, Greek philosophical concepts) but organised by a spatial ordering principle, Ontological Spatial Encoding (OSE), that appears to be the manuscript's own design: substantia tokens (ok-) systematically precede accidens tokens (ot-) at three simultaneously operating scales (between-section, within-section folio-order, within-line token-order). Key results by chapter group: Chapters 1–10 (Statistical Architecture and Method): The ok-/ot- binary ratio gradient across manuscript sections is confirmed at Spearman ρ = 1.000 (p = 0.017, 8 sections). The PASA method, the CIM four-layer annotation framework (L1–L4), and the PASM five-type grammatical model are established. Thirty-six EVA root families are confirmed at ★★★ or above. Chapters 11–13 (Grammar, Provenance, and Comparative Alignment): The PA-type prescription grammar (Pseudo-Apuleius, 11-slot alignment, ★★★★★) and PT-type stellar habitus grammar (Ptolemy/Albumasar) are specified. The manuscript's intellectual provenance is situated within the Bologna-Padua scholastic tradition through alignment with Pietro d'Abano's Conciliator and Paul of Venice's Summa Naturalium. The dam/sanguis binary polarity is confirmed (OR = 12.8, p = 0.0015). Chapters 14–15 (Vel/Si Analysis, OSE, and Annotation): The vel/si disjunction candidate analysis is completed (air confirmed ★★★; Currier A/B hypothesis retracted). OSE is demonstrated across three spatial scales. The first systematic line-level annotation database is produced: 911 lines (17.8% of ZL3b) at 100% root-family coverage. Chapter 16 (Structural Trial Renderings): 60 representative lines from all seven sections are rendered in the five-layer format (EVA → L1 → L2 Latin analogue → L3 English gloss → L4 Japanese gloss). All entries with unresolved tokens carry explicit caveat notation. Chapter 17 (L3/L4 Renderings and the Limits of Reconstruction): The terminus of Phase 1. Structural renderings are provided for four sections — Biological (241 lines), Herbal (178 lines), Stars (83 lines), and Pharmaceutical (81 lines) — selected at ≥90% coverage and ★★★. All renderings carry the three obligatory markers (coverage / confidence / unresolved tokens) and are bounded by a ★★★ line-level ceiling; they are conditional structural renderings, not translations. Three sections (Zodiac, Astronomical, Cosmological) are explicitly not rendered, with the structural reason stated for each. A fourth line of evidence is established: a systematic comparison against the Antidotarium Nicolai confirms that the Pharmaceutical section belongs to a non-quantitative recipe register (no numeral-profile closed class detected; ★★★★), distinct from Antidotaria-type genres. Falsification conditions F1–F5 and one pre-registered genre-control test are stated before execution. The chapter closes with an explicit inventory of open problems (semantic cores of sh-/ch-/d- stems; five body-part roots; three planetary identifications; four Aristotelian categories) and a reservation against premature phonetic reconstruction. What this series does not claim: No phonetic decoding. No translation in any natural language. The phonetically agnostic method has not been exhausted; the open problems documented in Chapter 17 define the programme for Phase 2. For full statistical tables, confidence ratings, and the 5,110-line annotation database, see the individual chapter PDFs and the supplementary file PASA_all_sections_v26_Zenodo.xlsx. 日本語 ヴォイニッチ手稿 統計的構造解析: 音価不依存構造分析(PASA)— 第1〜17章 架川 蓮 / Ren Kagawa(ArchiFlow AI)· 2026年 分析エンジン:Claude Sonnet 4.6(Anthropic)+ Codex(OpenAI)独立検証 コーパス:ZL3b ver_53(37,394トークン・227フォリオ・イェール大学バイネッケ図書館 MS 408・c.1404–1438) 本シリーズはヴォイニッチ手稿の音価不依存構造分析を提示する。全17章を通じて、いかなるEVA文字にも音価を割り当てない。中心的な問いは「文字はどんな音を表すか」ではなく、「分布統計のみから、どのような構造的・意味論的組織が確立できるか」である。 第1〜17章を通じた最重要の発見:ヴォイニッチ手稿は一貫した知的枠組み——ボローニャ-パドヴァ伝統(c.1310–1420)のスコラ的医学的宇宙論(Speculativa Medicina)——を符号化している。語彙は自然言語(ラテン語・アラビア語・ギリシャ哲学概念)から借用されているが、語順は手稿独自の設計原理と思われる存在論的空間符号化(OSE:Ontological Spatial Encoding)によって組織されている。実体トークン(ok-)が附帯性トークン(ot-)に対して、3つの同時作動スケール(セクション間・フォリオ順・行内トークン順)で系統的に先行する。 章グループ別の主要結果: 第1〜10章(統計的構造とPASA手法の確立): セクション間のok-/ot-比率勾配をSpearman ρ=1.000(p=0.017・8セクション)で確認。PASA手法・CIM四層注釈フレームワーク(L1〜L4)・PASM五型文法モデルを確立。36語根族を★★★以上で確認。 第11〜13章(文法・知的来歴・比較テキスト照合): PA型処方文法(偽アプレイウス・11スロット完全照合・★★★★★)とPT型星的habitus文法(プトレマイオス/アルブマサル)を仕様化。手稿の知的来歴をダバーノ『調停論』とパウルス・ヴェネトゥス『自然学大全』との照合によりボローニャ-パドヴァ伝統に位置付ける。dam/sanguis二項極性を確認(OR=12.8・p=0.0015)。 第14〜15章(vel/si分析・OSE・注釈): vel/si候補分析を完結(air確立★★★;Currier A/B仮説撤回)。OSEを3空間スケールで実証。最初の系統的行単位注釈データベースを作成:ZL3bの911行(17.8%)を100%語根族被覆で注釈。 第16章(構造的試訳レンダリング): 全7セクションから代表60行を五層形式(EVA→L1→L2ラテン語類比→L3英語グロス→L4日本語グロス)でレンダリング。未確立語根を含む全エントリに明示的な留保表記を付す。 第17章(L3/L4レンダリングと再構成の限界): 第1フェーズの終着点。四セクション——Biological(241行)・Herbal(178行)・Stars(83行)・Pharmaceutical(81行)——についてカバレッジ90%以上・★★★の行の構造的試訳を提示。全試訳行に三点必須マーカー(カバレッジ/確信度/未解読トークン)を付し、行レベル上限★★★に拘束する。これらは条件付き構造的試訳であって翻訳ではない。三セクション(Zodiac・Astronomical・Cosmological)は意図的に試訳しないことを宣言し、各セクションについてその構造的理由を明示する。第四の証拠系列を確立:Antidotarium Nicolaiとの系統的比較により、Pharmaceuticalセクションが非定量処方レジスターに属すること(数詞的プロファイルを持つ閉鎖クラスを検出せず;★★★★)——Antidotaria型ジャンルと区別されること——を確認。反証条件F1〜F5と事前登録済みジャンル統制テストを実行前に明文化。章末では未解決課題の明示的目録(sh-/ch-/d-語幹の意味中核・身体部位語根5点・惑星同定3点・アリストテレス的カテゴリー4点)と、時期尚早な音価再構成に対する留保を記録する。 本シリーズが主張しないこと: 音声的解読なし。いかなる自然言語への翻訳もなし。音価不依存の手法はいまだ尽くされていない;第17章で記録した未解決問題が第2フェーズの研究プログラムを定義する。 統計テーブル・確信度評価・5,110行注釈データベースの詳細は、各章のPDFおよび補足ファイル PASA_all_sections_v26_Zenodo.xlsx を参照されたい。