NEW PROTEIN INS - 3630 - 2159779-2161221 (GRCH38) - START_1348 - CODON_CTG - 27AA - PLDDT_76,6

This technical dossier presents the structural characterization andbioengineering properties of a novel open reading frame (DarkORF) associated with theINS genetic locus (Identifier: 3630). The nucleotide sequence is mapped at chromosomalcoordinates 2159779-2161221 (GRCH38), precisely positioned inside Reading Frame+1 with an initialization point at 1348 bp. Computational translation yielded a continuouspolypeptide chain of 27 amino acids, exhibiting a theoretical molecular weight of3379,87 Da and an isoelectric point (pI) of 10,36. Advanced structural predictionmodeling via AlphaFold/ColabFold architecture achieved a mean confidence score(pLDDT) of 76,6%. This exceptionally high score indicates a rigid, well-defined alphahelixtopological architecture with maximum atomic-level accuracy, suitable forimmediate crystallographic validation. Thermodynamic benchtop screening classified theprotein framework status as Estavel, validating its viability for industrial proteinexpression and synthetic gene optimization protocols in Escherichia coli systems.Este dossiê técnico apresenta a caracterização estrutural e aspropriedades de bioengenharia de uma nova matriz de leitura aberta (DarkORF)associada ao lócus genético do gene INS (Identificador: 3630). A sequência denucleotídeos está mapeada nas coordenadas cromossômicas 2159779-2161221(GRCH38), posicionada precisamente dentro do Frame de Leitura +1 com início em1348 bp. A tradução computacional resultou em uma cadeia polipeptídica contínua de27 aminoácidos, exibindo um peso molecular teórico de 3379,87 Da e ponto isoelétrico(pI) de 10,36. O modelo avançado de predição estrutural via arquiteturaAlphaFold/ColabFold atingiu um score de confiança médio (pLDDT) de 76,6%. Estescore excepcionalmente elevado indica uma arquitetura topológica de hélice-alfa rígidae bem definida, com máxima precisão em nível atômico, adequada para validaçãocristalofráfica imediata. A triagem termodinâmica de bancada classificou o status doesqueleto proteico como Estavel, validando sua viabilidade para protocolos deexpressão proteica industrial e otimização gênica sintética em sistemas de Escherichiacoli.

Authors

Publication Details

Journal
Zenodo (CERN European Organization for Nuclear Research)
Published
2026-06-12
DOI
https://doi.org/10.5281/zenodo.20671453
Primary Topic
Protein Structure and Dynamics
Type
preprint
Controls
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ALL TIME
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preprint

NEW PROTEIN INS - 3630 - 2159779-2161221 (GRCH38) - START_1348 - CODON_CTG - 27AA - PLDDT_76,6

Ailton Douglas de Souza Moreno
Zenodo (CERN European Organization for Nuclear Research)
Protein Structure and Dynamics
preprint

NEW PROTEIN INS - 3630 - 2159779-2161221 (GRCH38) - START_1348 - CODON_CTG - 27AA - PLDDT_76,6

Ailton Douglas de Souza Moreno
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Abstract

This technical dossier presents the structural characterization andbioengineering properties of a novel open reading frame (DarkORF) associated with theINS genetic locus (Identifier: 3630). The nucleotide sequence is mapped at chromosomalcoordinates 2159779-2161221 (GRCH38), precisely positioned inside Reading Frame+1 with an initialization point at 1348 bp. Computational translation yielded a continuouspolypeptide chain of 27 amino acids, exhibiting a theoretical molecular weight of3379,87 Da and an isoelectric point (pI) of 10,36. Advanced structural predictionmodeling via AlphaFold/ColabFold architecture achieved a mean confidence score(pLDDT) of 76,6%. This exceptionally high score indicates a rigid, well-defined alphahelixtopological architecture with maximum atomic-level accuracy, suitable forimmediate crystallographic validation. Thermodynamic benchtop screening classified theprotein framework status as Estavel, validating its viability for industrial proteinexpression and synthetic gene optimization protocols in Escherichia coli systems.Este dossiê técnico apresenta a caracterização estrutural e aspropriedades de bioengenharia de uma nova matriz de leitura aberta (DarkORF)associada ao lócus genético do gene INS (Identificador: 3630). A sequência denucleotídeos está mapeada nas coordenadas cromossômicas 2159779-2161221(GRCH38), posicionada precisamente dentro do Frame de Leitura +1 com início em1348 bp. A tradução computacional resultou em uma cadeia polipeptídica contínua de27 aminoácidos, exibindo um peso molecular teórico de 3379,87 Da e ponto isoelétrico(pI) de 10,36. O modelo avançado de predição estrutural via arquiteturaAlphaFold/ColabFold atingiu um score de confiança médio (pLDDT) de 76,6%. Estescore excepcionalmente elevado indica uma arquitetura topológica de hélice-alfa rígidae bem definida, com máxima precisão em nível atômico, adequada para validaçãocristalofráfica imediata. A triagem termodinâmica de bancada classificou o status doesqueleto proteico como Estavel, validando sua viabilidade para protocolos deexpressão proteica industrial e otimização gênica sintética em sistemas de Escherichiacoli.

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