Beyin-Kalp Ekseni Üzerine Bilgisayar Tabanlı Bir Çalışma: Kalp Yetmezliğinde miR-423-5p

Kalp yetmezliği (KY), yüksek mortalite ve morbidite oranlarına sahip çoklu organ ve sistemleri etkileyen kompleks bir klinik sendromdur. Son yıllarda kalp ve beyin arasındaki çift yönlü iletişimi tanımlayan kalp-beyin ekseni (KBA), KY’nin patofizyolojisinin anlaşılmasında önemli bir kavram olarak öne çıkmıştır. Bu eksen kapsamında dolaşımdaki mikroRNA’ların (miRNA), organlar arası moleküler sinyal iletiminde rol oynayabileceği düşünülmektedir. Bu çalışmanın amacı, KY’de değiştiği bildirilen miRNA’lar arasından miR-423-5p’yi odak miRNA olarak belirlenmesi, KBA ile ilişkili olası moleküler mekanizmaları bilgisayar tabanlı yöntemlerle araştırmayı amaçlamıştır. Bu amaç doğrultusunda insan kan, serum veya plazma örneklerinden elde edilen literatür verileri dahil edilme kriterleri göz önüne alınarak incelenmiş elde edilen miRNA'lar ortaya koyulmuştur. Bu miRNA'ların beyinde ekspresyonları ve bağımsız çalışmada tutarlı biçimde değişimi incelenmiştir. Bu doğrultuda miR-423-5p potensiyel aday olarak belirlenmişr ve miR-423-5p’nin hedef genleri miRDB, TargetScan, miRWalk ve DIANA-microT veritabanları kullanılarak tahmin edilmiştir. Bu dört databasde -ortak olarak yer alan 75 yüksek güvenilir hedef gen analize dahil edilerek fonksiyonel zenginleştirme ve protein–protein etkileşim analizleri Metascape platformu aracılığıyla gerçekleştirilmiştir. Analiz sonuçları, miR-423-5p hedef genlerinin hücre içi sinyal iletimi, protein fosforilasyonu ve nöronal süreçlerle ilişkili biyolojik yolaklarda yoğunlaştığını göstermiştir. Ayrıca PRKACA, bu ağın merkezinde yer alan başlıca hub protein olarak tanımlanmıştır. Sonuç olarak bu çalışma, miR-423-5p’nin HF'de BKA ile ilişkili moleküler ağlarda potansiyel bir düzenleyici rol oynayabileceğini göstermek olup ve gelecekte yapılacak deneysel çalışmalar için hipotez oluşturucu bir temel sunmaktadır.