Partitionnement de niches, adaptation et productivité dans les récifs coralliens

Cette thèse explore l'écologie trophique des poissons récifaux afin de déterminer comment les stratégies alimentaires influencent la structure des communautés, la répartition des espèces et leur adaptabilité aux changements environnementaux. En m'appuyant sur les paramètres de niche trophique, j'ai analysé la coexistence, la compétition et l'architecture des réseaux trophiques à différentes échelles spatiales. Les résultats révèlent un cycle trophique : la taille de la niche influence la distribution des espèces, qui façonne la biomasse locale et les hiérarchies trophiques. Les méso-prédateurs, notamment les invertivores, représentent la majeure partie de la biomasse et conservent des niches stables malgré les perturbations, sans doute en raison de réponses écologiques spécifiques. Cette étude met en lumière l'importance de la diversité et de la plasticité trophiques pour maintenir les fonctions écologiques face aux changements. Sur le plan méthodologique, j'ai combiné l'analyse visuelle des contenus stomacaux, le metabarcoding ADN et les isotopes stables afin d'optimiser l'estimation trophique. Ces méthodes se sont révélées complémentaires : le metabarcoding a permis d'identifier une large diversité de proies, tandis que les isotopes ont fourni des métriques robustes. Ensemble, ces résultats permettent de comprendre les dynamiques trophiques des poissons de récif, soulignant l'intérêt des approches basées sur la niche pour évaluer la diversité fonctionnelle, la résilience des écosystèmes et orienter la conservation face aux changements globaux.