Insights Into Pharmaceutical and Fine Chemistry Using Density Functional Theory, Data-Driven Approaches and Novel Descriptors

Aquesta tesi integra química quàntica moderna, anàlisi estadística i aprenentatge automàtic per desenvolupar estratègies computacionals que aprofundeixen en la comprensió mecanística i permeten prediccions basades en dades en sistemes químics diversos rellevants per a la química fina i farmacèutica.Una primera línia de recerca va explorar la reacció sense metalls de transició C(sp²)–N de trifluoroborats–iminiums primaris alquil-substituïts (pTIMs) amb N-fluorobenzensulfonimida (NFSI), en col·laboració amb Sandoz, cercant rutes més verdes cap a intermediaris farmacèutics. Les investigacions computacionals van descobrir un escenari mecànic dual amb dues vies paral·leles que expliquen els intermediaris observats, subproductes i estereoselectivitat, oferint una visió unificada consistent amb els experiments.De manera independent, s’ha estudiat la hidroformilació de l’estirè catalitzada per pal·ladi utilitzant formaldehid com a substitut del gas de síntesi, en col·laboració amb el Dr. Godard i IFF. Aquest treball és rellevant acadèmicament i industrialment, donat l’avantatge econòmic del Pd i la seva regioselectivitat diferent respecte dels catalitzadors de Rh. L’estudi va revelar un cicle catalític inesperat de Pd(II) que forma selectivament aldehids lineals, competint amb una via Pd(0)/Pd(II) d’hidrogenació. Models microcinètics parametritzats van identificar passos clau i van aclarir el paper dels additius com a cocatalitzadors i la influència de les condicions de reacció.A més, la tesi investiga com els patrons de fluoració i les arquitectures moleculars afecten la lipofília (logD) i la basicitat (pKa) en derivats fluorats de piridina. Regressions multilineals amb descriptors estructurals i computacionals van establir sòlides relacions quantitatives estructura–propietat (QSPR), oferint claus per modular propietats farmacocinètiques en el disseny de fàrmacs.Finalment, s’han desenvolupat descriptors 3D i basats en grafs per predir activitat i enantioselectivitat en catàlisi organometàl·lica. L’eina oberta NEST quantifica volums ocupats de catalitzadors allargats; 3D-AIMDA capta efectes estereo-electrònics a partir d’anàlisi QTAIM; i un enfocament graf-teòric modelitza barreres d’activació i estats de transició.

Authors

Publication Details

Journal
Tesis Doctorals en Xarxa (Consorci de Serveis Universitaris de Catalunya)
Published
2025-10-24
Primary Topic
Catalytic Cross-Coupling Reactions
Type
article
Field-Weighted Citation Impact
0.00
Controls
|||
ALL TIME
JAN
FEB
MAR
APR
MAY
JUN
JUL
AUG
SEP
OCT
article

Insights Into Pharmaceutical and Fine Chemistry Using Density Functional Theory, Data-Driven Approaches and Novel Descriptors

Gonzalo Darío Nuñez Rapan
Tesis Doctorals en Xarxa (Consorci de Serveis Universitaris de Catalunya)
Catalytic Cross-Coupling Reactions
article

Insights Into Pharmaceutical and Fine Chemistry Using Density Functional Theory, Data-Driven Approaches and Novel Descriptors

Gonzalo Darío Nuñez Rapan
article en

Abstract

Aquesta tesi integra química quàntica moderna, anàlisi estadística i aprenentatge automàtic per desenvolupar estratègies computacionals que aprofundeixen en la comprensió mecanística i permeten prediccions basades en dades en sistemes químics diversos rellevants per a la química fina i farmacèutica.Una primera línia de recerca va explorar la reacció sense metalls de transició C(sp²)–N de trifluoroborats–iminiums primaris alquil-substituïts (pTIMs) amb N-fluorobenzensulfonimida (NFSI), en col·laboració amb Sandoz, cercant rutes més verdes cap a intermediaris farmacèutics. Les investigacions computacionals van descobrir un escenari mecànic dual amb dues vies paral·leles que expliquen els intermediaris observats, subproductes i estereoselectivitat, oferint una visió unificada consistent amb els experiments.De manera independent, s’ha estudiat la hidroformilació de l’estirè catalitzada per pal·ladi utilitzant formaldehid com a substitut del gas de síntesi, en col·laboració amb el Dr. Godard i IFF. Aquest treball és rellevant acadèmicament i industrialment, donat l’avantatge econòmic del Pd i la seva regioselectivitat diferent respecte dels catalitzadors de Rh. L’estudi va revelar un cicle catalític inesperat de Pd(II) que forma selectivament aldehids lineals, competint amb una via Pd(0)/Pd(II) d’hidrogenació. Models microcinètics parametritzats van identificar passos clau i van aclarir el paper dels additius com a cocatalitzadors i la influència de les condicions de reacció.A més, la tesi investiga com els patrons de fluoració i les arquitectures moleculars afecten la lipofília (logD) i la basicitat (pKa) en derivats fluorats de piridina. Regressions multilineals amb descriptors estructurals i computacionals van establir sòlides relacions quantitatives estructura–propietat (QSPR), oferint claus per modular propietats farmacocinètiques en el disseny de fàrmacs.Finalment, s’han desenvolupat descriptors 3D i basats en grafs per predir activitat i enantioselectivitat en catàlisi organometàl·lica. L’eina oberta NEST quantifica volums ocupats de catalitzadors allargats; 3D-AIMDA capta efectes estereo-electrònics a partir d’anàlisi QTAIM; i un enfocament graf-teòric modelitza barreres d’activació i estats de transició.

Tesis Doctorals en Xarxa (Consorci de Serveis Universitaris de Catalunya)
Openalex Percentile: Top 31%
Catalytic Cross-Coupling Reactions
AI Navigator

Ask Laika to Summarize, Analyze, and Connect papers live on the map.

Summarize Papers & Methodologies

Extract key findings, datasets, and comparative methods across publications.

Benchmark Rankings & Visual Analytics

Rank top research institutions, authors, funders, topics, and journals by Field-Weighted Citation Impact (FWCI) and paper volume with instant charts.

Connect Distant Disciplines

Bridge topological clusters on the map to find hidden collaborative intersections.