Modulation du microbiote des vecteurs pour le contrôle des pathogènes vectoriels

Le cheptel corse, composé d'ovins, de caprins, de porcins et de bovins, est principalement élevé dans des systèmes d'élevage extensifs. Les interactions fréquentes entre le bétail, la faune sauvage et les populations humaines favorisent donc la circulation des tiques et des micro-organismes transmis par les tiques. Une forte prévalence de bactéries transmises par les tiques des familles Rickettsiaceae et Anaplasmataceae a été signalée chez les chèvres (Anaplasma ovis), les moutons (A. ovis), les bovins (Anaplasma marginale, Anaplasma phagocytophilum et Ehrlichia minasensis) et les tiques (Rickettsia spp.) en Corse. Certaines de ces bactéries (par exemple, A. phagocytophilum et Rickettsia sp.) sont zoonotiques et pathogènes pour l'homme. Actuellement, il n'existe pas de mesures préventives pour le contrôle des tiques et des maladies transmises par les tiques. Le microbiome des tiques est un ensemble très complexe de micro-organismes en interaction qui ont un impact sur la physiologie des tiques et leur compétence vectorielle. Récemment, nous avons montré que les vaccins anti-microbiote des tiques peuvent produire une mortalité élevée chez celles-ci pendant leur alimentation. Les vaccins anti-microbiotiques peuvent également moduler le microbiome des tiques et peuvent donc être utilisés comme outil de contrôle de la transmission des pathogènes transmis par les tiques. Dans ce projet, nous utiliserons le séquençage de nouvelle génération des amplicons 16S pour étudier la diversité taxonomique et fonctionnelle du microbiome de Rhipicephalus bursa et Hyalomma marginatum, les principales tiques vectrices de pathogènes chez le bétail en Corse. En utilisant les réseaux de co-occurrence et la détection à haut débit des pathogènes, nous identifierons ensuite les bactéries clés interagissant avec les pathogènes détectés transmis par les tiques. Les bactéries clés de voûte seront utilisées pour formuler des vaccins anti-microbiotiques afin de bloquer l'acquisition et/ou la transmission des pathogènes.