Role of DNA methylation in virulence and in host adaptation in the phytopatogene bacteria Ralstonia pseudosolanacearum

Cette thèse explore le rôle des méthyltransférases orphelines (MTases) dans la virulence et l'adaptation de la bactérie phytopathogène Ralstonia pseudosolanacearum, agent du flétrissement bactérien. Grâce à des approches combinant séquençage long (PacBio, Nanopore), analyses transcriptomiques (RNA-seq), génétique inverse et phénotypage, le travail identifie deux motifs méthylés dans le génome de la souche GMI1000 (GTWWAC et YGCCGGCR), respectivement ciblés par les MTases RamC (6mA) et RcmB (5mC). L'inactivation individuelle de ces MTases n'affecte ni la croissance ni la virulence, mais certaines combinaisons de doubles mutants, notamment ΔramA-ΔrcmB et ΔramC-ΔrcmB, entraînent une perte significative de virulence et des altérations majeures de l'expression génique. Des gènes liés aux phages, à la réparation de l'ADN et à la réponse SOS sont fortement dérégulés, suggérant une implication indirecte de la méthylation dans le maintien de l'intégrité génomique. Ces résultats révèlent l'importance du dialogue entre méthylations de l'adénine et de la cytosine dans la régulation de la physiologie bactérienne, et ouvrent de nouvelles perspectives sur les fonctions épigénétiques dans l'interaction plante-pathogène.