Variable selection with FDR control for high dimensional competing risk data

<div> Dans les études biomédicales, les données de grande dimension sont courantes (génomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique, etc.), et les outcome sont souvent sujets à des risques concurrents. Le modèle de Fine-Gray pénalisé peut être utilisé pour sélectionner les covariables ayant les effets les plus forts sur l'outcome lors de l'analyse de données de risques concurrents en grande dimension. Cependant, la sélection des variables influentes reste un défi, car les modèles pénalisés peuvent inclure de nombreuses variables non pertinentes, ce qui ralentit l'identification de biomarqueurs. Nous proposons d'utiliser Integrated Path Stability Selection (IPSS) pour améliorer la sélection de variables et réduire les faux positifs, tout en contrôlant le False Discovery Rate (FDR). Grâce à des simulations, nous montrons que cette méthode permet de réduire drastiquement le nombre de faux positifs par rapport aux techniques existantes, tout en conservant une performance robuste dans l'identification des vrais positifs et dans les capacités prédictives. Cela souligne son potentiel pour améliorer l'analyse des données avec risques concurrents en grande dimension dans la recherche biomédicale. Enfin, la méthode est validée par une étude de cas réelle. </div>

Authors

Publication Details

Journal
SPIRE - Sciences Po Institutional REpository
Published
2025-06-02
Primary Topic
Statistical Methods and Inference
Type
article
Field-Weighted Citation Impact
0.00
Controls
|||
ALL TIME
JAN
FEB
MAR
APR
MAY
JUN
JUL
AUG
SEP
OCT
article

Variable selection with FDR control for high dimensional competing risk data

Guillemette Marot, Génia Babykina, Hugo Cannafarina
SPIRE - Sciences Po Institutional REpository
Statistical Methods and Inference
article

Variable selection with FDR control for high dimensional competing risk data

Guillemette Marot, Génia Babykina, Hugo Cannafarina
article en

Abstract

<div> Dans les études biomédicales, les données de grande dimension sont courantes (génomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique, etc.), et les outcome sont souvent sujets à des risques concurrents. Le modèle de Fine-Gray pénalisé peut être utilisé pour sélectionner les covariables ayant les effets les plus forts sur l'outcome lors de l'analyse de données de risques concurrents en grande dimension. Cependant, la sélection des variables influentes reste un défi, car les modèles pénalisés peuvent inclure de nombreuses variables non pertinentes, ce qui ralentit l'identification de biomarqueurs. Nous proposons d'utiliser Integrated Path Stability Selection (IPSS) pour améliorer la sélection de variables et réduire les faux positifs, tout en contrôlant le False Discovery Rate (FDR). Grâce à des simulations, nous montrons que cette méthode permet de réduire drastiquement le nombre de faux positifs par rapport aux techniques existantes, tout en conservant une performance robuste dans l'identification des vrais positifs et dans les capacités prédictives. Cela souligne son potentiel pour améliorer l'analyse des données avec risques concurrents en grande dimension dans la recherche biomédicale. Enfin, la méthode est validée par une étude de cas réelle. </div>

SPIRE - Sciences Po Institutional REpository
Openalex Percentile: Top 21%
Statistical Methods and Inference
AI Navigator

Ask Laika to Summarize, Analyze, and Connect papers live on the map.

Summarize Papers & Methodologies

Extract key findings, datasets, and comparative methods across publications.

Benchmark Rankings & Visual Analytics

Rank top research institutions, authors, funders, topics, and journals by Field-Weighted Citation Impact (FWCI) and paper volume with instant charts.

Connect Distant Disciplines

Bridge topological clusters on the map to find hidden collaborative intersections.