Etude fonctionnelle des complexes moléculaires Pol IV-CLSY-SHH1 dans la biogenèse des petits ARN et la répression des transposons

Chez les eucaryotes, l’ARN polymérase II (Pol II) synthétise les ARNm traduits en protéines. Cependant, les génomes contiennent aussi des éléments transposables (TE) pouvant perturber ces mécanismes. Chez Arabidopsis thaliana, l’ARN polymérase IV (Pol IV) transcrit les TE pour produire des petits ARN interférents (siARN) guidant la méthylation de l’ADN et leur répression. Pol IV s’assemble avec les protéines CLSY1/2/3/4 et SHH1, mais son mode d’association spécifique restait inconnu. Durant ma thèse, j’ai identifié un motif d’ancrage aux CLSY dans la « clamp head » de Pol IV, soutenant un modèle « un CLSY pour une Pol IV » où quatre complexes distincts produisent des siARN spécifiques. J’ai aussi découvert une plateforme propre à CLSY1, essentielle à son interaction avec SHH1, toutes deux conservées chez les angiospermes, suggérant une coévolution pour la répression des TE. Enfin, mes travaux chez Physcomitrium patens révèlent une divergence Pol IV-CLSY, soulignant leur spécialisation dans la stabilité génomique des plantes.