Un atlas génique de la formation et de la migration de la crête neurale par transcriptomique spatiale

La transition épithéliale-mésenchymateuse (EMT), processus par lequel une cellule épithéliale se transforme en une cellule mobile et migratrice, est importante tant au cours du développement que dans les pathologies. Chez l'embryon, la crête neurale (CN), subit la EMT et se différencie en de multiples dérivés (système nerveux périphérique, mélanocytes...). Une EMT déficiente dans la CN cause des maladies congénitales graves. Cependant, dans le cancer, l’EMT permet aux cellules cancéreuses de devenir invasives et métastaser, comme dans le mélanome, un cancer dérivé de la CN. Ici, nous utilisons la technologie de transcriptomique spatiale (ST) Vizgen MERFISH pour dresser une carte de coexpression de 157 gènes et révéler la coexpression des principaux régulateurs de la EMT et de la migration des cellules CN. En outre, un régulateur de la migration des cellules CN, PFKFB4, s'est avéré réguler également la migration de certaines cellules de mélanome in vivo.