Auto-assemblage supramoléculaire de petits peptides de type Fmoc-A-SS-B et MA-hR10 en solution : Étude par des simulations de dynamique moléculaire classique

Nous avons étudié des systèmes aqueux à base de peptides par simulations de dynamique moléculaire. Dans une première partie nous avons examiné l'impact de la concentration et de la dissociation en Fmoc-A-SH et HS-B sur l’interaction entre peptides Fmoc-A-SS-B. Nous avons montré que la chiralité des peptides joue un rôle important, les agrégats (D)-Fmoc-A-SS-B présentant un comportement plus dynamique que ceux des isomères (L). Les interactions avec des protéines, l'AP et la BSA, ont révélé que les (D)-peptides ont tendance à s’adsorber rapidement à la BSA via des interactions labiles, tandis que les (L)-peptides ont une cinétique plus lente mais mettant en jeu des interactions intermoléculaires plus stables. La seconde partie concerne l'auto-assemblage de peptides à base de méthacrylate (MA-hR) et révèle que la concentration affecte de manière significative l'agrégation. Les impuretés telles que R10 conduisent à des agrégats plus petits, où la longueur de la chaîne d'arginine modifie les schémas d'agrégation. Les variations de température et la présence de contre-ions jouent un rôle crucial dans la formation, la structure et la stabilité des agrégats.