Étude des mécanismes de réponse des semences de tomate aux stress abiotiques et identification de composés promoteurs de la germination

La germination des graines est une étape cruciale du développement des plantes, mais elle est sensible aux aléas environnementaux. Les stress abiotiques tels que le stress hydrique ou salin affectent fortement la germination. Cela a des répercussions sur les rendements agricoles et peut ainsi entraîner des pertes financières importantes, en particulier pour les cultures à forte valeur ajoutée comme la tomate (Solanum lycopersicum). Les objectifs de cette thèse sont de comprendre comment les graines de tomate réagissent au stress hydrique et d'identifier des molécules d'origine naturelle pouvant améliorer la tolérance des graines aux stress abiotiques. Nous avons étudié le rôle de l'albumen lors de la germination sous stress hydrique en combinant des approches physiologiques, transcriptomiques et métabolomiques. Nous avons montré que l'albumen est nécessaire pour percevoir le stress hydrique et pour restreindre la germination. Les analyses RNAseq et LC-MS/MS ont montré que la réponse au stress hydrique est spécifique au tissu et au stade d'imbibition. Nous avons également démontré que la perception du stress par l'embryon ne se fait pas de façon autonome mais repose sur un dialogue chimique et moléculaire avec l'albumen. Ce travail a aussi exploré les effets d'extraits métaboliques d'endophytes fongiques de graines de tomate pour améliorer la tolérance de la germination aux stress hydrique et salin. Un large crible d'extraits métaboliques bruts a été réalisé sans permettre d'identifier de candidats prometteurs. En revanche, la caractérisation chimique des métabolites fongiques à mis en évidence la présence de molécules bioactives dans ces extraits. Nous avons identifié des métabolites corrélés à la tolérance au stress par une analyse LC-MS/MS. Ces composés sont des candidats potentiels pour le développement de biostimulants à base de molécules naturelles.