A comparative study of normalization and differential abundance analysis methods for microbiome data

마이크로바이옴은 특정 환경에 서식하는 미생물들의 집합체로, 다양한 질병 및 환경 요인과의 연관성으로 인해 최근 주목받고 있다. 마이크로바이옴 데이터는 구성성, 희소설, 영과잉 등의 특성을 지니며, 이러한 특성을 반영한 통계적 분석이 필요하다. 본 연구에서는 주요 정규화 기법과 차등 풍부도 분석 방법을 중심으로 관련 방법론을 체계적으로 정리하고, 실제 대장암 데이터를 활용하여 여러 분석 방법을 비교하였다. 이를 통해 각 방법의 특성과 장단점을 파악하고, 적절한 분석 방법 선택을 위한 실질적인 근거를 제시하였다.

Publication Details

Journal
Journal of the Korean Data and Information Science Society
Published
2025-09-30
DOI
https://doi.org/10.7465/jkdi.2025.36.5.757
Primary Topic
Waste Management and Recycling
Type
article
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A comparative study of normalization and differential abundance analysis methods for microbiome data

Journal of the Korean Data and Information Science Society
Waste Management and Recycling
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A comparative study of normalization and differential abundance analysis methods for microbiome data

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Abstract

마이크로바이옴은 특정 환경에 서식하는 미생물들의 집합체로, 다양한 질병 및 환경 요인과의 연관성으로 인해 최근 주목받고 있다. 마이크로바이옴 데이터는 구성성, 희소설, 영과잉 등의 특성을 지니며, 이러한 특성을 반영한 통계적 분석이 필요하다. 본 연구에서는 주요 정규화 기법과 차등 풍부도 분석 방법을 중심으로 관련 방법론을 체계적으로 정리하고, 실제 대장암 데이터를 활용하여 여러 분석 방법을 비교하였다. 이를 통해 각 방법의 특성과 장단점을 파악하고, 적절한 분석 방법 선택을 위한 실질적인 근거를 제시하였다.

Journal of the Korean Data and Information Science SocietyVol. 36(5)
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Waste Management and Recycling
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