Molecular profile of respiratory sequelae in the COVID-19 patient

La majoria dels supervivents de la COVID-19 greu experimenten símptomes multiorgànics després de la fase aguda, sent el dany pulmonar una de les principals preocupacions (fins al 70-80% dels pacients entre 3 i 12 mesos després de l'alta hospitalària). Malauradament, el maneig de les seqüeles està limitat pel la poca informació disponible sobre els mecanismes moleculars involucrats en elles. En aquest context, ens vam proposar identificar els mecanismes patobiològics associats a l’aparició i persistència del dany pulmonar en supervivents de la COVID-19 greu. En primer lloc, es va utilitzar el machine learning per a desenvolupar signatures moleculars, incloent-hi una signatura de 14 mARNs, dos perfils de microARN i dos clústers de proteïnes, associats amb el deteriorament pulmonar en supervivents de síndrome del destret respiratori agut tres mesos després de l'alta hospitalària. Les signatures estaven constituïdes per mediadors d'inflamació, resposta immune, persistència viral, angiogènesi, supervivència, creixement i diferenciació cel·lular, remodelació tissular, fibrosi i senescència cel·lular. Els perfils proteòmics i transcriptòmics van classificar els pacients amb un deteriorament moderat a sever de la difusió pulmonar. En segon lloc, es va construir una signatura de microARN relacionada amb la disfunció pulmonar en supervivents de COVID-19 crític un any després de l'alta hospitalària, utilitzant machine learning. El targetoma estava enriquit en rutes d'inflamació, reparació tissular i senescència. Els resultats van ser consistents quan es van explorar en bases de dades de proteòmica i RNA-sequencing. En resum, les seqüeles pulmonars en supervivents de COVID-19 greu greu indueixen una empremta molecular específica, implicada en mecanismes moleculars multifactorials. Aquesta aproximació podria servir com a font per al desenvolupament de nous biomarcadors i agents terapèutics.