Analyse optogénétique en cellule unique de la réponse immédiate à une modification génétique soudaine chez Saccharomyces cerevisiae

La façon dont les mutations permettent aux cellules d’adapter leur physiologie est complexe, dynamique et hétérogène. C’est un processus fondamental de l’évolution souvent étudié à l’échelle des populations longtemps après l’apparition des mutations. Les premières réponses suite à une modification génétique sont donc rarement observées. Je quantifie ici les effets immédiats suite à une altération génétique sur des cellules uniques de Saccharomyces cerevisiae. Pour ce faire, j’ai combiné deux technologies préexistantes, l’une biologique et l’autre physico-chimique. La première est une enzyme optogénétique appelée LiCre qui permet de recombiner des sites spécifiques d’ADN lorsqu’elle est activée par de la lumière bleue. La seconde est une puce microfluidique où des cellules uniques sont encapsulées dans des gouttelettes et observées au cours du temps. Cela permet de quantifier le taux de croissance et le rendement de plusieurs centaines de microcolonies provenant de cellules uniques.