Caracterización genómica de los mecanismos de adaptación de <i>Pseudomonas aeruginosa</i> en pacientes con bronquiectasias

Resumen Objetivos Pseudomonas aeruginosa es una de las principales causas de infección bronquial crónica (IBC), especialmente en pacientes con enfermedades como fibrosis quística (FQ), enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC), asma y bronquiectasias (BQ). Si bien la IBC en el contexto clínico de la FQ ha sido objeto de numerosos estudios, la literatura existente en el caso de IBC y BQ es mucho más escasa. El objetivo del presente estudio es determinar el perfil de sensibilidad antibiótica de 100 aislados bacterianos identificados en 100 pacientes con bronquiectasias e infección bronquial crónica por Pseudomonas aeruginosa , así como caracterizar algunos de los mecanismos de adaptación en 55 aislados, mediante secuenciación del genoma completo (WGS, por sus siglas en inglés). Métodos La sensibilidad antibiótica frente a 10 antipseudomónicos se determinó utilizando el sistema de microdilución en caldo MicroScan WalkAway. La WGS se llevó a cabo con el kit de preparación de librerías de Illumina. La secuenciación de las librerías indexadas se realizó en un secuenciador MiSeq benchtop de Illumina, generando lecturas pareadas de 300 pares de bases. Resultados La mayor parte de las mutaciones de pérdida de función se encontraron c en los genes que codifican el sistema de la bomba de expulsión MexAB-OprM, el clúster génico pvd y el receptor FpvA, así como en los genes involucrados en la motilidad tipo twitching , como chpA y fimV . Conclusiones Los datos obtenidos indican que Pseudomonas aeruginosa se adapta a la IBC mediante la acumulación de mutaciones de pérdida de función en diversos genes que que derivan en diferentes fenotipos y podrían orientar el desarrollo de nuevas terapias alternativas.