Phylogenetic and biochemical insights into the diversity of TET peptidases in Archaea

Les peptidases TET sont des aminopeptidases géantes présentes dans les trois domaines du vivant. Elles sont supposées intervenir dans la protéolyse intracellulaire, en aval du protéasome. Des études structurales ont montré que ces enzymes forment des complexes tétraédriques dodécamériques creux. Chez les Archées, les peptidases TET ont principalement été étudiées chez des espèces de l’ordre des Thermococcales, révélant quatre types distincts de TET. Cependant, la répartition et la diversité fonctionnelle de ces peptidases dans les autres lignées archéennes restent mal connue, et leur rôle biologique précis est toujours indéterminé. Dans cette étude, des critères d’identification basés sur des éléments structuraux conservés sont définis, permettant l’identification des TETs à grande échelle. En utilisant ces critères pour le screening de 4 016 génomes d'archées, la première analyse complète de la distribution des TETs chez ces organismes est présentée, mettant à jour une diversité insoupçonnée. À travers une analyse phylogénétique, une classification des TETs archéennes en onze familles est proposée. La caractérisation biochimique de six nouvelles enzymes, issues de familles jusqu’ici non explorées et représentant une large diversité taxonomique, offre ainsi un aperçu complet de la diversité fonctionnelle des TETs. Enfin, la combinasion des résultats des analyses phylogénétiques et biochimiques éclaire l’histoire évolutive des TETs et apporte de nouvelles perspectives sur leurs potentielles fonctions biologiques.