PEPTIDÔMICA CLÍNICA E POTENCIAL APLICAÇÃO AO DIAGNÓSTICO E PROGNÓSTICO DA LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA: ABORDAGEM POR ESPECTROMETRIA DE MASSA E APRENDIZADO DE MÁQUINA

A leucemia mieloide aguda (LMA) é uma neoplasia hematológica marcada por heterogeneidade clínica e molecular. Mutações como FLT3-ITD e a PML-RARA impactam o prognóstico. A integração entre peptidômica clínica, espectrometria de massa e aprendizado de máquina oferece uma abordagem inovadora para a identificação de potenciais biomarcadores plasmáticos e estratificação molecular em contextos clínicos. Comparar o perfil peptídico plasmático de pacientes com LMA em relação a controles saudáveis e explorar diferenças associadas à mutação FLT3 e à presença da fusão PML-RARA. Foram analisadas amostras de plasma de 13 pacientes com LMA, atendidos no Hospital das Clínicas da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG), e 12 indivíduos controles saudáveis pareados por sexo e faixa etária. Os espectros foram obtidos por espectrometria de massa do tipo Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization – Time of Flight (MALDI-TOF) e processados no software R (pacotes MALDIquant e MALDIquantForeign), com aplicação de transformação logarítmica, suavização (Savitzky- Golay), correção de baseline (TopHat), normalização por TIC, alinhamento e binning. A matriz de intensidades foi submetida a análises supervisionadas com árvores de decisão (CHAID) e regressões logísticas binárias. Para os subgrupos FLT3 e PML-RARA, empregou-se análise de componentes principais (PCA) e o teste de Wilcoxon. Com base na matriz de intensidades gerada a partir dos espectros de plasma processados por MALDI-TOF/MS, aplicou-se uma análise supervisionada para comparação entre pacientes com LMA e indivíduos controles. Três íons apresentaram diferenças estatisticamente significativas (p < 0,001), sendo dois com maior intensidade nos pacientes com LMA e um com menor intensidade. Os íons aumentados mostraram forte correlação positiva entre si e correlação negativa com o íon reduzido. O modelo CHAID demonstrou alta capacidade discriminativa, identificando pontos de corte eficazes para separação entre os grupos. As regressões logísticas confirmaram esses achados com consistência estatística. A análise PCA revelou tendência de separação entre os subgrupos PML-RARA positivo e negativo, enquanto não se observou distinção clara entre pacientes FLT3 positivo e negativo. As variáveis identificadas apresentaram robustez estatística e comportamento biológico compatível com potenciais biomarcadores plasmáticos. A integração de testes estatísticos e modelos supervisionados reforçou a capacidade discriminativa dessas assinaturas na diferenciação entre pacientes com LMA e indivíduos controles. Embora não signifivativa a separação observada entre os subgrupos PML-RARA positivo e negativo, embora preliminar, sugere a existência de assinaturas peptídicas associadas à presença do rearranjo PML-RARA, apontando para sua possível aplicabilidade na estratificação molecular da LMA. A abordagem peptidômica demonstrou elevado potencial para distinguir pacientes com LMA de indivíduos saudáveis, evidenciando assinaturas plasmáticas com potencial valor diagnóstico e/ou prognóstico. Além disso, foi observada boa estratificação molecular associadas ao rearranjo PML-RARA. A combinação entre espectrometria de massa e modelos supervisionados consolida-se como uma estratégia promissora para o diagnóstico e o prognóstico da LMA, com perspectivas de aplicação clínica em contextos do diagnóstico de precisão e medicina personalizada.

Authors

Institutions

Publication Details

Journal
Hematology Transfusion and Cell Therapy
Published
2025-10-01
DOI
https://doi.org/10.1016/j.htct.2025.104627
Primary Topic
Acute Myeloid Leukemia Research
Type
article
Field-Weighted Citation Impact
0.00
Controls
|||
ALL TIME
JAN
FEB
MAR
APR
MAY
JUN
JUL
AUG
SEP
OCT
article

PEPTIDÔMICA CLÍNICA E POTENCIAL APLICAÇÃO AO DIAGNÓSTICO E PROGNÓSTICO DA LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA: ABORDAGEM POR ESPECTROMETRIA DE MASSA E APRENDIZADO DE MÁQUINA

Douglas José Coutinho, Flábio R. Araújo, AdP Sabino, H. Figueiredo et al.
Hematology Transfusion and Cell Therapy
Acute Myeloid Leukemia Research
article

PEPTIDÔMICA CLÍNICA E POTENCIAL APLICAÇÃO AO DIAGNÓSTICO E PROGNÓSTICO DA LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA: ABORDAGEM POR ESPECTROMETRIA DE MASSA E APRENDIZADO DE MÁQUINA

Douglas José Coutinho, Flábio R. Araújo, AdP Sabino, H. Figueiredo, Javier González de la Rosa, Manuel Pedro Magalhães, André Ulisses Dantas Batista, L.O. Ramos, F Fravretto
article en

Abstract

A leucemia mieloide aguda (LMA) é uma neoplasia hematológica marcada por heterogeneidade clínica e molecular. Mutações como FLT3-ITD e a PML-RARA impactam o prognóstico. A integração entre peptidômica clínica, espectrometria de massa e aprendizado de máquina oferece uma abordagem inovadora para a identificação de potenciais biomarcadores plasmáticos e estratificação molecular em contextos clínicos. Comparar o perfil peptídico plasmático de pacientes com LMA em relação a controles saudáveis e explorar diferenças associadas à mutação FLT3 e à presença da fusão PML-RARA. Foram analisadas amostras de plasma de 13 pacientes com LMA, atendidos no Hospital das Clínicas da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG), e 12 indivíduos controles saudáveis pareados por sexo e faixa etária. Os espectros foram obtidos por espectrometria de massa do tipo Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization – Time of Flight (MALDI-TOF) e processados no software R (pacotes MALDIquant e MALDIquantForeign), com aplicação de transformação logarítmica, suavização (Savitzky- Golay), correção de baseline (TopHat), normalização por TIC, alinhamento e binning. A matriz de intensidades foi submetida a análises supervisionadas com árvores de decisão (CHAID) e regressões logísticas binárias. Para os subgrupos FLT3 e PML-RARA, empregou-se análise de componentes principais (PCA) e o teste de Wilcoxon. Com base na matriz de intensidades gerada a partir dos espectros de plasma processados por MALDI-TOF/MS, aplicou-se uma análise supervisionada para comparação entre pacientes com LMA e indivíduos controles. Três íons apresentaram diferenças estatisticamente significativas (p < 0,001), sendo dois com maior intensidade nos pacientes com LMA e um com menor intensidade. Os íons aumentados mostraram forte correlação positiva entre si e correlação negativa com o íon reduzido. O modelo CHAID demonstrou alta capacidade discriminativa, identificando pontos de corte eficazes para separação entre os grupos. As regressões logísticas confirmaram esses achados com consistência estatística. A análise PCA revelou tendência de separação entre os subgrupos PML-RARA positivo e negativo, enquanto não se observou distinção clara entre pacientes FLT3 positivo e negativo. As variáveis identificadas apresentaram robustez estatística e comportamento biológico compatível com potenciais biomarcadores plasmáticos. A integração de testes estatísticos e modelos supervisionados reforçou a capacidade discriminativa dessas assinaturas na diferenciação entre pacientes com LMA e indivíduos controles. Embora não signifivativa a separação observada entre os subgrupos PML-RARA positivo e negativo, embora preliminar, sugere a existência de assinaturas peptídicas associadas à presença do rearranjo PML-RARA, apontando para sua possível aplicabilidade na estratificação molecular da LMA. A abordagem peptidômica demonstrou elevado potencial para distinguir pacientes com LMA de indivíduos saudáveis, evidenciando assinaturas plasmáticas com potencial valor diagnóstico e/ou prognóstico. Além disso, foi observada boa estratificação molecular associadas ao rearranjo PML-RARA. A combinação entre espectrometria de massa e modelos supervisionados consolida-se como uma estratégia promissora para o diagnóstico e o prognóstico da LMA, com perspectivas de aplicação clínica em contextos do diagnóstico de precisão e medicina personalizada.

Hematology Transfusion and Cell TherapyVol. 47
Universidade Federal de Minas Gerais (BR)
Openalex Percentile: Top 60%
Acute Myeloid Leukemia Research
AI Navigator

Ask Laika to Summarize, Analyze, and Connect papers live on the map.

Summarize Papers & Methodologies

Extract key findings, datasets, and comparative methods across publications.

Benchmark Rankings & Visual Analytics

Rank top research institutions, authors, funders, topics, and journals by Field-Weighted Citation Impact (FWCI) and paper volume with instant charts.

Connect Distant Disciplines

Bridge topological clusters on the map to find hidden collaborative intersections.