AVALIAÇÃO DE ALGORITMOS DE MACHINE LEARNING NA PREDIÇÃO DE RESULTADOS DE PCR EM TEMPO REAL (QPCR) PARA DETECÇÃO DO VÍRUS LINFOTRÓPICO DE CÉLULAS T HUMANAS (HTLV), NA FUNDAÇÃO HEMOPA, BELÉM PARÁ

A triagem para o HTLV (Vírus Linfotrópico de Células T Humanas), especialmente os tipos 1 e 2, é essencial em bancos de sangue para prevenir a transmissão transfusional e garantir a segurança do receptor. Na Fundação Centro de Hemoterapia e Hematologia do Pará (HEMOPA), a rotina inclui rastreamento sorológico inicial e confirmação molecular pela reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR), que detecta o DNA proviral e reduz falsos-positivos. Ferramentas de Inteligência Artificial (IA), como algoritmos de Machine Learning (ML), vêm se tornando cada vez mais relevantes na saúde, nesse contexto, podem integrar diversas variáveis para predizer o desfecho de testes moleculares e auxiliar o controle de qualidade laboratorial. Avaliar o desempenho de diferentes algoritmos de machine learning na predição dos resultados confirmatórios de qPCR para HTLV em doadores inaptos. Estudo retrospectivo, transversal e quantitativo com dados obtidos no Laboratório de Biologia Molecular e Celular, da Fundação Hemopa no período de 2015‒2019. A pesquisa foi aprovada no comitê de ética sob CAEE n° 9.004.819.7.0000.8187. A plataforma utilizada foi Orange Data Mining, com dados de 632 exames de qPCR para HTLV. Destes, 80% (n=506) foram reservados para o treino dos modelos e 20% (n=126) para teste. Os dados utilizados tiveram o desfecho removido (detectável/indetectável). A divisão do conjunto de teste foi feita de forma estratificada e aleatória, mantendo proporções de 20% de casos detectáveis (27 de 136) e 20% de indetectáveis (99 de 496). As variáveis preditoras incluíram idade, sexo, raça autodeclarada, residência, estado civil, tipo de doador (primeira vez, repetição ou esporádico), número de doações e resultado sorológico. Durante o treinamento, aplicou-se validação cruzada estratificada por meio do widget “Test and Score” e matriz de confusão para cálculo de acurácia e contagem de erros com intuito de filtrar os melhores modelos. Os algoritimos Neural Network, k-Nearest Neighbors, Random Forest, AdaBoost e Gradient Boosting obtiveram os melhores resultados, com 124 acertos o que correspondendo a 98,41% de acurácia, com apenas dois erros cada. Naïve Bayes apresentou 123 acertos (97,6% de acurácia) e Logistic Regression registrou 122 acertos (96,8% de acurácia). Em todos os casos, os 27 resultados detectáveis foram corretamente previstos. A incorporação de algoritmos de machine learning ao controle de qualidade mostra-se promissora, pois modelos como redes neurais e ensembles alcançaram mais de 98% na análise. À medida que a base de treinamento crescer, espera-se um aumento na robustez e confiabilidade das predições. Os modelos testados exibiram alta capacidade preditiva, acima de 96% de acurácia. Para avançar rumo à aplicação prática, recomenda-se ampliar o volume de dados e agregar variáveis clínicas relevantes, além de realizar estudos multicêntricos que validem a robustez desses sistemas em diferentes cenários. Dessa forma, a IA poderá ser uma ferramenta adicional de segurança.

Authors

Institutions

Publication Details

Journal
Hematology Transfusion and Cell Therapy
Published
2025-10-01
DOI
https://doi.org/10.1016/j.htct.2025.105806
Primary Topic
T-cell and Retrovirus Studies
Type
article
Field-Weighted Citation Impact
0.00
Controls
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ALL TIME
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AVALIAÇÃO DE ALGORITMOS DE MACHINE LEARNING NA PREDIÇÃO DE RESULTADOS DE PCR EM TEMPO REAL (QPCR) PARA DETECÇÃO DO VÍRUS LINFOTRÓPICO DE CÉLULAS T HUMANAS (HTLV), NA FUNDAÇÃO HEMOPA, BELÉM PARÁ

Érica Linhares Reis, Dela Miranda, P. R. O. da Silva, C. Gurgel Margutti do Amaral et al.
Hematology Transfusion and Cell Therapy
T-cell and Retrovirus Studies
article

AVALIAÇÃO DE ALGORITMOS DE MACHINE LEARNING NA PREDIÇÃO DE RESULTADOS DE PCR EM TEMPO REAL (QPCR) PARA DETECÇÃO DO VÍRUS LINFOTRÓPICO DE CÉLULAS T HUMANAS (HTLV), NA FUNDAÇÃO HEMOPA, BELÉM PARÁ

Érica Linhares Reis, Dela Miranda, P. R. O. da Silva, C. Gurgel Margutti do Amaral, Susi Missel Pacheco, Regina Célia de Oliveira, N. Almeida, N. F. de Azevedo, KadS Braile
article en

Abstract

A triagem para o HTLV (Vírus Linfotrópico de Células T Humanas), especialmente os tipos 1 e 2, é essencial em bancos de sangue para prevenir a transmissão transfusional e garantir a segurança do receptor. Na Fundação Centro de Hemoterapia e Hematologia do Pará (HEMOPA), a rotina inclui rastreamento sorológico inicial e confirmação molecular pela reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR), que detecta o DNA proviral e reduz falsos-positivos. Ferramentas de Inteligência Artificial (IA), como algoritmos de Machine Learning (ML), vêm se tornando cada vez mais relevantes na saúde, nesse contexto, podem integrar diversas variáveis para predizer o desfecho de testes moleculares e auxiliar o controle de qualidade laboratorial. Avaliar o desempenho de diferentes algoritmos de machine learning na predição dos resultados confirmatórios de qPCR para HTLV em doadores inaptos. Estudo retrospectivo, transversal e quantitativo com dados obtidos no Laboratório de Biologia Molecular e Celular, da Fundação Hemopa no período de 2015‒2019. A pesquisa foi aprovada no comitê de ética sob CAEE n° 9.004.819.7.0000.8187. A plataforma utilizada foi Orange Data Mining, com dados de 632 exames de qPCR para HTLV. Destes, 80% (n=506) foram reservados para o treino dos modelos e 20% (n=126) para teste. Os dados utilizados tiveram o desfecho removido (detectável/indetectável). A divisão do conjunto de teste foi feita de forma estratificada e aleatória, mantendo proporções de 20% de casos detectáveis (27 de 136) e 20% de indetectáveis (99 de 496). As variáveis preditoras incluíram idade, sexo, raça autodeclarada, residência, estado civil, tipo de doador (primeira vez, repetição ou esporádico), número de doações e resultado sorológico. Durante o treinamento, aplicou-se validação cruzada estratificada por meio do widget “Test and Score” e matriz de confusão para cálculo de acurácia e contagem de erros com intuito de filtrar os melhores modelos. Os algoritimos Neural Network, k-Nearest Neighbors, Random Forest, AdaBoost e Gradient Boosting obtiveram os melhores resultados, com 124 acertos o que correspondendo a 98,41% de acurácia, com apenas dois erros cada. Naïve Bayes apresentou 123 acertos (97,6% de acurácia) e Logistic Regression registrou 122 acertos (96,8% de acurácia). Em todos os casos, os 27 resultados detectáveis foram corretamente previstos. A incorporação de algoritmos de machine learning ao controle de qualidade mostra-se promissora, pois modelos como redes neurais e ensembles alcançaram mais de 98% na análise. À medida que a base de treinamento crescer, espera-se um aumento na robustez e confiabilidade das predições. Os modelos testados exibiram alta capacidade preditiva, acima de 96% de acurácia. Para avançar rumo à aplicação prática, recomenda-se ampliar o volume de dados e agregar variáveis clínicas relevantes, além de realizar estudos multicêntricos que validem a robustez desses sistemas em diferentes cenários. Dessa forma, a IA poderá ser uma ferramenta adicional de segurança.

Hematology Transfusion and Cell TherapyVol. 47
Universidade da Amazônia (BR), Fundação Hemopa (BR)
Openalex Percentile: Top 67%
T-cell and Retrovirus Studies
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