Fine-Scale Variation in the Gut Microbiome of the European Pied Flycatcher Ficedula hypoleuca in Central Spain

El microbioma intestinal es un mediador clave de rasgos de estrategias vitales en animales, desempeñando funciones esenciales que pueden permitir a los hospedadores explotar nuevos nichos. Sin embargo, las fuentes de variación en la abundancia y composición del microbioma dentro de las especies de vertebrados no son del todo claras, especialmente en aves silvestres. En este estudio, utilizamos la secuenciación del gen 16S rRNA para describir el microbioma fecal de una especie de paseriforme migratorio transahariano que se reproduce en el centro de España, el papamoscas cerrojillo Ficedula hypoleuca. Investigamos las diferencias en la composición y diversidad microbiana entre el hábitat natural de la especie (robledal) y un hábitat de creación reciente (pinar) situado a solo 1 km de distancia. Muestreamos tanto a machos y hembras adultas como a polluelos (de 13 días de edad). Los resultados mostraron una diferencia en la composición del microbioma de las aves entre hábitats, con individuos del robledal presentando una mayor abundancia de varios taxones bacterianos, como Actinobacteriota y Proteobacteria, mientras que las aves del pinar mostraron una mayor abundancia de Verrucomicrobiota. No observamos diferencias en la composición microbiana según el sexo o la edad, aunque los polluelos y las hembras reproductoras del robledal presentaron una mayor abundancia de ciertas bacterias. También investigamos diferencias en las funciones metabólicas del microbioma y detectamos una mayor abundancia relativa de bacterias con rutas de biosíntesis y degradación de ácidos grasos, así como rutas de generación de precursores de metabolitos y energía en las aves del robledal. En las aves del pinar, encontramos una mayor abundancia de bacterias con rutas de biosíntesis de L-alanina y de las pentosas fosfato. Nuestro estudio mejora la comprensión de la composición del microbioma intestinal de paseriformes migratorios insectívoros y muestra que el hábitat de cría puede actuar como un modulador clave de dicha composición en aves.—Videvall, E., Ruiz-Limón, P., Martínez-Padilla, J., Moreno-Indias, I., Canal, D. y Muriel, J. (2026). Variación a pequeña escala en la microbiota intestinal del papamoscas cerrojillo Ficedula hypoleuca en España central. Ardeola, 73: 23-42.