MOLECULAR MARKER ANALYSIS OF ADAPTATION OF KAZAKHSTAN VARIANTS OF INFLUENZA A (H5N1) VIRUS TO MAMMALS

This article focuses on the molecular genetic characterisation of influenza A (H5N1) viruses isolated from wild waterfowl that winter on the shores of the northern part of the Caspian Sea. The results of full-genome sequencing of the Kazakh A (H5N1) variants are presented, alongside an analysis of molecular markers related to mammalian adaptation. Phylogenetic studies indicate that the new viruses belong to clade 2.3.4.4b, which is characterised by high pathogenicity and the potential for interspecies transmission. The mutations found in several key genes (PB2, HA, NS, etc.) reflect the virus's potential for mammalian adaptation and could increase its zoonotic risk. Given their role in migratory routes and the possibility of spreading highly pathogenic A (H5N1) strains to new regions, the importance of continuous monitoring of wild waterfowl populations in the Northern Caspian area is emphasised. Статья посвящена молекулярно-генетической характеристике вирусов гриппа A(H5N1), выделенных от зимующих диких птиц на побережье Северного Каспия. Представлены результаты полногеномного секвенирования казахстанских вариантов вируса гриппа А (H5N1) и анализа молекулярных маркеров адаптации к млекопитающим. Филогенетическое исследование показывают принадлежность новых вирусов к кладу 2.3.4.4b, характеризующиеся с высокой патогенностью и способностью к межвидовой передаче. Выявленные мутации в нескольких ключевых генах (PB2, HA, NS и др.) отражают потенциал адаптации вируса к млекопитающим и могут повышать зоонозный риск. Подчёркивается важность непрерывного мониторинга популяций диких водоплавающих птиц в районе Северного Каспия, учитывая его роль в миграциях птиц и возможность распространения высокопатогенных штаммов гриппа A(H5N1) на новые территории.