Pairwise graph edit distance characterizes the impact of the construction method on pangenome graphs
pancat compare is published as free Rust software under the AGPL3.0 open source license. Source code and documentation are available at https://github.com/dubssieg/rs-pancat-compare. Snapshot available on Software Heritage at swh:1:dir:61acda8ba3dac1709ed60530147d3871831be629.
Authors
- Matthias Zytnicki (ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4895-8731)
- Thomas Faraut (ORCID: https://orcid.org/0000-0001-5156-3434)
- Claire Lemaitre (ORCID: https://orcid.org/0000-0001-8675-170X)
- Siegfried Dubois (ORCID: https://orcid.org/0009-0001-9800-0644)
Institutions
- Centre National de la Recherche Scientifique (FR)
- École Nationale Vétérinaire de Toulouse (FR)
- Université Fédérale de Toulouse Midi-Pyrénées (FR)
- Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (FR)
- Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (FR)
- Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (FR)
- Université de Rennes (FR)
Publication Details
- Journal
- Bioinformatics
- Published
- 2025-05-08
- DOI
- https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btaf291
- Citations
- 1
- Primary Topic
- Genomics and Phylogenetic Studies
- Type
- article
- Field-Weighted Citation Impact
- 0.81
Funders
- Agence Nationale de la Recherche
- Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement