Identification of the G-protein coupled receptor in <italic>Ramazzottius varieornatus</italic> and analysis of its response pattern to gamma irradiation

G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor, GPCR)是一类在细胞信号传导中起关键作用的膜蛋白, 广泛分布于各类真核生物中, 在辐射损伤和防护中发挥重要作用. 缓步动物(Tardigrades), 俗称水熊虫(water bear), 以其多种极端环境耐受性而闻名, 但目前尚未有对水熊虫GPCR家族及其在辐射响应的研究报道. 本研究旨在探讨变形拉氏熊虫(Ramazzottius varieornatus)GPCR的鉴定、分类、进化分析、亚细胞定位及其在辐射响应中的功能特点. 首先, 利用数据库资源和生物信息学工具鉴定了变形拉氏熊虫GPCR蛋白, 并根据结构域和序列特征将其分类为A、B、C、F四个家族, 其中A家族的GPCR数量最多; 接着, 将GPCR分为“细胞形态生物”、“真核生物”、“后生动物”、“缓步动物”四个进化年龄级别, 发现后生动物最近共同祖先时出现的GPCR显著富集. 亚细胞定位发现变形拉氏熊虫的GPCR不仅只存在于细胞膜, 还存在于其他细胞器膜中, 且这些存在于其它细胞器膜中的GPCR大部分是缓步动物特异的; 最后, 基于变形拉氏熊虫在500 Gy伽马射线辐照后的转录组数据, 通过差异表达分析和加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis, WGCNA), 揭示了辐照后GPCR的响应变化, 初步探讨了缓步动物特异GPCR在超强辐射耐受中发挥的潜在作用.

Authors

Publication Details

Journal
Scientia Sinica Vitae
Published
2025-04-22
DOI
https://doi.org/10.1360/ssv-2024-0362
Primary Topic
Neurobiology and Insect Physiology Research
Type
article
Field-Weighted Citation Impact
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article

Identification of the G-protein coupled receptor in <italic>Ramazzottius varieornatus</italic> and analysis of its response pattern to gamma irradiation

Zefeng Hua, Mingwang Duan, Qian Wen, Zhixiang Yang et al.
Scientia Sinica Vitae
Neurobiology and Insect Physiology Research
article

Identification of the G-protein coupled receptor in <italic>Ramazzottius varieornatus</italic> and analysis of its response pattern to gamma irradiation

Zefeng Hua, Mingwang Duan, Qian Wen, Zhixiang Yang, Yifan Ning, Dong Yang
article en

Abstract

G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor, GPCR)是一类在细胞信号传导中起关键作用的膜蛋白, 广泛分布于各类真核生物中, 在辐射损伤和防护中发挥重要作用. 缓步动物(Tardigrades), 俗称水熊虫(water bear), 以其多种极端环境耐受性而闻名, 但目前尚未有对水熊虫GPCR家族及其在辐射响应的研究报道. 本研究旨在探讨变形拉氏熊虫(Ramazzottius varieornatus)GPCR的鉴定、分类、进化分析、亚细胞定位及其在辐射响应中的功能特点. 首先, 利用数据库资源和生物信息学工具鉴定了变形拉氏熊虫GPCR蛋白, 并根据结构域和序列特征将其分类为A、B、C、F四个家族, 其中A家族的GPCR数量最多; 接着, 将GPCR分为“细胞形态生物”、“真核生物”、“后生动物”、“缓步动物”四个进化年龄级别, 发现后生动物最近共同祖先时出现的GPCR显著富集. 亚细胞定位发现变形拉氏熊虫的GPCR不仅只存在于细胞膜, 还存在于其他细胞器膜中, 且这些存在于其它细胞器膜中的GPCR大部分是缓步动物特异的; 最后, 基于变形拉氏熊虫在500 Gy伽马射线辐照后的转录组数据, 通过差异表达分析和加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis, WGCNA), 揭示了辐照后GPCR的响应变化, 初步探讨了缓步动物特异GPCR在超强辐射耐受中发挥的潜在作用.

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