Exploring the Somatic Mutation Landscape of T4N0: A Comparative Perspective on Late Stage II and Stage III Colon Cancer

ANTECEDENTES: Entre las facetas de la patogénesis del cáncer de colon se encuentra la paradoja de supervivencia entre el cáncer de colon T4N0 (estadio II) y el cáncer de colon anyTN1 (estadio III). Existen pocos estudios genómicos que investiguen por qué la enfermedad T4N0 se considera peor que el cáncer de colon en estadio III.OBJETIVO:Demostramos un enfoque multifacético para desentrañar las complejidades genómicas del cáncer de colon T4N0 y sus diferencias con el cáncer de colon T123N0 y anyTN1 utilizando información sobre mutaciones somáticas.DISEÑO:Estudio retrospectivo de mutaciones somáticas y su impacto pronóstico en la supervivencia.CONFIGURACIÓN:Realizado con el Atlas del Genoma del Cáncer y el National cBioPortal for Cancer Genomics.PACIENTES:Estratificamos nuestras muestras según la estadificación TNM: T4N0, T123N0 y anyTN1.MEDIDAS PRINCIPALES DE RESULTADOS:Comparamos la frecuencia de mutaciones entre los grupos mediante la prueba exacta de Fisher con un valor de p ≤ 0,05. Realizamos un análisis de vías para mapear redes biológicas enriquecidas con mutaciones somáticas. Investigamos la interacción de mutaciones somáticas y validamos nuestros resultados mediante el análisis de supervivencia de Kaplan-Meier en conjuntos de datos independientes.RESULTADOS:Se observaron 30 genes con mutaciones significativamente diferenciales, exclusivos del cáncer de colon T4N0, tras las comparaciones entre T123N0 y anyTN1. Entre estos genes, DIDO1, CACNA1B y ALMS1 mostraron interacción de mutaciones somáticas en un patrón coexistente con otros genes mutados. El análisis de vías reveló que la señalización de efrina B, la señalización de óxido nítrico y la señalización de calcio estaban enriquecidas con mutaciones y contribuían a la patogénesis de T4N0. El análisis de supervivencia confirmó aún más nuestros hallazgos.LIMITACIONES:Estudio retrospectivo y número de pacientes.CONCLUSIONES:Existen patrones de mutación somática en los tumores de cáncer de colon T4N0 que están significativamente ausentes en los tumores de colon T123N0 y anyTN1. La interacción de mutaciones somáticas destacó el papel de DIDO1, CACNA1B y ALMS1 en la patogénesis de T4N0, que contenía mutaciones apreciables que se predijo que serían graves. Entre estos genes, DIDO1 se asoció con una disminución de la supervivencia. (Traducción-Yesenia Rojas-Khalil ).