Improvement of Nanopore sequencing provides access to high quality genomic data for multi-component CRESS-DNA plant viruses
In this study, we demonstrated an accessible and effective Nanopore-based method for high-quality genomic characterisation of CRESS-DNA viruses, comparable to Sanger sequencing. Face with of increasing challenges posed by viral CRESS-DNA plant diseases, integrating this approach into routine workflows could pave the way for more proactive responses to viral epidemics.
Authors
- Pierre Lefeuvre (ORCID: https://orcid.org/0000-0003-2645-8098)
- Justin S. Pita (ORCID: https://orcid.org/0000-0003-2815-5904)
- Andy Brousse
- Philippe Roumagnac (ORCID: https://orcid.org/0000-0001-5002-6039)
- Jean‐Michel Lett (ORCID: https://orcid.org/0000-0003-1585-5338)
- Fidèle Tiendrébéogo (ORCID: https://orcid.org/0000-0002-3619-3268)
- Daniel H. Otron (ORCID: https://orcid.org/0009-0009-4236-5212)
- Babbitha Fenelon
- Emmanuel Fernandez
- Denis Filloux
- Murielle Hoareau
- Cécile Hoareau
Institutions
- Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (FR)
- Can Tho University (VN)
- Institut Agro Montpellier (FR)
- Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (FR)
- Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (RE)
- Services déconcentrés d'appui à la recherche Occitanie-Montpellier (FR)
- Institut de Recherche pour le Développement (FR)
- Plant Health Institute de Montpellier (FR)
- Université Félix Houphouët-Boigny (CI)
Publication Details
- Journal
- Virology Journal
- Published
- 2025-03-18
- DOI
- https://doi.org/10.1186/s12985-025-02694-x
- Citations
- 6
- Primary Topic
- Plant Virus Research Studies
- Type
- article
- Field-Weighted Citation Impact
- 10.50
Funders
- Bill and Melinda Gates Foundation
- Agence Nationale de la Recherche
- Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
- Conseil Régional de La Réunion
- Foreign, Commonwealth and Development Office
- European Regional Development Fund