Review and practical excursus on the comparison between traditional statics methods and Classification And Regression Tree (CART) in real-life data: Low protein diet compared to Mediterranean diet in patients with chronic kidney disease
The Classification and Regression Tree (CART) is a supervised learning approach useful used to segment the space of and the predictors/features space into smaller homogeneous regions that are, represented in a decision tree. It computes the selection of features automatically, in contrast to traditional statistic methods. In this review, we compared CART to traditional statistics in patients who did not attempt a diet to patients who followed a low-protein diet (LPD) or the Mediterranean diet in chronic kidney disease (CKD) patients, and we analyzed them using linear regression and CART methods. In our example, diet adherence proved to be the factor with the greatest impact on renal function decline, but CART failed to detect significant differences between LPD and Mediterranean diet. Similar results were found using traditional statics, but CART gave a model with the proportion of the explained outcome by the model ( R 2 ) higher by about 20%, thus a stronger model. In addition, CART allows quick and easy identification of the variables affecting the outcome with a simple visual representation through the decision tree, increasing the interpretability of the results. In summary, no difference in the impact of variables has been detected with the two methods, but CART gave us a more detailed model with a faster and easier interpretation. El Árbol de Clasificación y Regresión (CART) es un enfoque de aprendizaje supervisado usado para segmentar el espacio de los predictores/características en regiones homogéneas más pequeñas que se representan en un árbol de decisión. Calcula la selección de las características automáticamente, a diferencia de los étodos estadísticos tradicionales. En esta revisión, comparamos CART con la estadística tradicional en pacientes que no intentaron una dieta con pacientes que siguieron una Low Protein Diet (LPD) o la dieta mediterránea en pacientes con enfermedad renal crónica (ERC), y los analizamos utilizando regresión lineal y métodos CART. En nuestro ejemplo, la adherencia a la dieta demostró ser el factor con el mayor impacto en el deterioro de la función renal, pero CART no detectó diferencias significativas entre la LPD y la dieta mediterránea. Se encontraron resultados similares utilizando la estadística tradicional, pero CART proporcionó un modelo con la proporción del resultado explicado por el modelo (R 2 ) superior en aproximadamente un 20%, lo que resulta en un modelo más robusto. Además, CART permite la identificación rápida y sencilla de las variables que afectan el resultado con una representación visual simple a través del árbol de decisión, facilita la interpretabilidad de los resultados. Resumiendo, no se han detectado diferencias en el impacto de las variables con los dos métodos, pero CART nos proporcionó un modelo más detallado con una interpretación más rápida y sencilla.
Authors
- Elisa Longhitano (ORCID: https://orcid.org/0000-0002-5222-4431)
- Daniela Metro
- Domenico Santoro (ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4279-6559)
- Vincenzo Calabrese (ORCID: https://orcid.org/0000-0001-6333-5009)
- Guido Gembillo (ORCID: https://orcid.org/0000-0003-4823-9910)
- Angela Alibrandi (ORCID: https://orcid.org/0000-0001-6695-151X)
- Valeria Cernaro (ORCID: https://orcid.org/0000-0003-4396-5032)
- Veronica Maressa
- Domenico Maviglia
Institutions
- University of Messina (IT)
- Università degli Studi di Enna Kore (IT)
Publication Details
- Journal
- Nefrología
- Published
- 2025-01-27
- DOI
- https://doi.org/10.1016/j.nefro.2025.01.009
- Citations
- 2
- Primary Topic
- Liver Disease Diagnosis and Treatment
- Type
- article
- Field-Weighted Citation Impact
- 2.71