Parallel biobanking of post-COVID-19 cancer patient samples as an innovative route to multiomics screening
Compared to the concept of biobanks, which include one type of biomaterials from patients or a library of DNA samples, new types of biobanks shouldn’t be only repositories, but also infrastructure, which allows for innovative and translational research using biomaterials from patients. Also, parallel biobanking, including the simultaneous collection of various types of biomaterials (whole blood, plasma, exosomes, DNA, microRNA, leukocytes, tumor cells and their microenvironment - frozen with preservation of their viability, etc.) will allow them to be used in in-vitro models to test the effects of drugs, as well as to predict the development of treatment-resistant populations of cancer cells and cellular transformation. This biobanking approach opens new opportunities to study precancerous niches, rare forms of cancer and to develop personalized therapeutic strategies, giving researchers new opportunities for in vitro recapitulation of tissue mechanical and molecular changes, changes of signaling molecules profile and secretome. По сравнению с традиционным представлением о биобанках, включающих в себя один тип заготовляемых биоматериалов пациентов или коллекцию образцов ДНК, биобанки нового типа должны представлять собой не только репозитории, но и инфраструктуру, которая позволит проводить трансляционные и поисковые исследования с использованием биоматериалов от пациентов. Также, паралельное биобанкирование, включающее одновременный забор различных типов биоматериалов (цельная кровь, плазма, экзосомы, ДНК, микроРНК, лейкоциты, замороженные с сохранением своей жизнеспособности клетки опухолей и их микроокружения и т.д.) позволит использовать их в in vitro моделях для проверки действия лекарственных препаратов, а также для прогнозирования развития резистентных к лечению популяций раковых клеток и клеточной трансформации. Такой подход к биобанкированию открывает новые возможности для изучения предраковых ниш, редких форм рака и разработки персонализированных стратегий лечения, также обеспечивая возможность воспроизведения in vitro механической и молекулярной перестройки тканей, изменение профиля сигнальных молекул и секретома клеток.
Authors
- Dmitry Lifanov
- Н.С. Сукорцева (ORCID: https://orcid.org/0000-0002-7704-1658)
- G.A. Zhemerikin (ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4241-4856)
- Evgeniya Shabalina (ORCID: https://orcid.org/0000-0002-8184-7363)
- Asma Khalil (ORCID: https://orcid.org/0000-0003-2802-7670)
- P. A. Karalkin (ORCID: https://orcid.org/0000-0002-2838-0776)
- Artem Shiryaev (ORCID: https://orcid.org/0000-0001-9421-420X)
- Дуламсурэн Зоригт (ORCID: https://orcid.org/0000-0001-8133-689X)
- И. В. Решетов (ORCID: https://orcid.org/0000-0002-3888-8004)
- Elena V. Petersen
- Tatiana Pisareva
Institutions
- Moscow Institute of Physics and Technology (RU)
- Sechenov University (RU)
- P.A. Hertzen Moscow Oncology Research Institute (RU)
Publication Details
- Journal
- Голова и шея.
- Published
- 2024-12-27
- DOI
- https://doi.org/10.25792/hn.2024.12.4.147-153
- Primary Topic
- Cancer Genomics and Diagnostics
- Type
- article
- Field-Weighted Citation Impact
- 0.00
Funders
- Russian Science Foundation