POULTRY MICROBIOME: COMPOSITION, FUNCTIONS AND METHODS OF ANALYSIS

The avian gastrointestinal (GI) microbiome is a dynamic ecosystem with a complex and diverse composition. It is formed from the moment of embryo formation and continues to develop and modernize throughout life. The bulk of the intestinal microflora consists of bacteria, a smaller proportion of fungi and viruses, and trace amounts of archaea and protozoa. Each part of the digestive system performs functions that are important for the digestive process and absorption of nutrients. Different parts of the GI tract differ in their microbial composition; therefore, they can be considered separate ecosystems, albeit closely interconnected. Until recently, it was difficult to determine the impact of the intestinal microflora on the host organism. However, owing to the emergence and improvement of technologies in the field of sequencing, there has been a rapid growth of data with the help of which it is possible to assess the entire species diversity of intestinal microflora and the degree of its change under the influence of various external factors. The intestinal microflora directly or indirectly modulates the intestinal barrier function, digestion, host metabolism, and immune function. All the information obtained makes it possible to relate the composition of the microbiota to poultry performance indicators, such as growth rate and feed conversion rate. This knowledge can be applied to improve the digestive tract, which in turn will have a positive effect on the immune status of birds and their performance. Құстардың асқазан-ішек жолдарының (АІЖ) микробиомасы күрделі және неше түрлі құрамы бар динамикалық экожүйе болып табылады. Ол эмбрион пайда болған сәттен бастап қалыптасады және өмір бойы дамып, жаңартылып отырады. Ішек микрофлорасының негізгі бөлігі бактерияларға, аз бөлігі саңырауқұлақтар мен вирустарға толы келеді, аз мөлшерде архейлер мен қарапайымдылар кездеседі. Ас қорыту жүйесінің әр бөлімі қорыту және қоректік заттарды сіңіру үрдісінде маңызды қызметтерді орындайды. АІЖ әртүрлі бөлімдері микробтық құрамы бойынша ерекшеленеді, сондықтан оларды бір-бірімен тығыз байланыста болса да, бөлек экожүйелер ретінде қарастыруға болады. Соңғы уақытқа дейін ішек микрофлорасының ағза иесіне әсерін анықтау қиын болды. Бірақ секвенирлеу саласындағы технологиялардың пайда болуы мен жетілдірілуінің арқасында деректердің тез өсуі байқалады, соның көмегімен ішек микрофлорасының барлық түрлерінің әртүрлілігін, түрлі сыртқы факторлардың әсерінен өзгеру дәрежесін бағалауға болады. Ішек микрофлорасы ішектің тосқауыл қызметін, ас қорытуды, иесінің метаболизмін және иммундық қызметтерді тікелей немесе жанама түрде модуляциялайды. Алынған барлық ақпарат микробиотаның құрамының құстың өсу қарқыны мен жемнің конверсия дәрежесі сияқты өнімділік көрсеткіштерімен байланыстыруға мүмкіндік береді. Осы алынған ақпарат ас қорыту жүйесінің жұмысын жақсарту үшін қолданылады, бұл өз кезегінде құс ағзасының иммундық мәртебесіне және оның өнімділігіне оң әсерін тигізеді.