Comparative Transcriptome Analysis of Menadione-Treated Helicobacter pylori

Helicobacter pylori (H. pylori)는 전 세계 인구의 절반 이상이 감염된 그람 음성 세균으로, 위염, 소화성 궤양 및 위암과 관련이 있다. 만성감염은 위암 발생과 밀접한 관련이 있어 예방을 위한 노력이 필요하다. 메나 디온의 H. pylori에 대한 항균 및 항염증 작용을 이전 연구를 통해 보고하였으므로, 본 연구의 목적은 메나디 온 처리에 의해 유도된 H. pylori 유전자의 전사체 변화를 조사하고 NGS와 RT-PCR 결과를 비교 분석하는 것이다. NGS 분석 결과, 1,632개의 유전자 중 44개가 메나디온 처리에 의해 유의미하게 발현 변화가 나타났다. DNA 복제와 전사, 병원성 인자 및 T4SS 성분과 관련된 유전자 중 14개( dnaB, dnaE, gyrA, rpoA, rpoB, rpoN, vacA, flaA, flhA, alpB, virB2, virB7, virB8, virB10)는 하향 조절되었고 2개( flaB, virB4)는 상향 조절되었다. RT-PCR을 통해 16개 유전자의 발현 수준을 재확인한 결과, virB4를 제외한 모든 유전자가 NGS 와 동일한 변화를 보였다. 이러한 결과는 메나디온이 H. pylori의 성장 및 병원성과 관련된 다양한 인자들을 조절함으로써 H. pylori 감염의 잠재적인 치료제가 될 수 있음을 시사한다. 또한 메나디온 처리로 유의미하게 변화한 16개 유전자 중 한 개를 제외하고는 NGS와 RT-PCR에서 동일한 결과가 확인되어 NGS 분석이 세균 전사체 분석에도 유용하다는 것을 입증하였다.