Prediction of Drug-Induced Liver Injury Using Transformer
약인성 간손상(Drug-Induced Liver Injury, DILI)은 약물의 섭취 시 부작용으로 발생하는 간 손상을 의미하며, 간 기능 저하를 유발하여 치명적인 간질환을 초래하는 원인으로 손꼽힌다. 본 연구에서는 트랜스포머의 주의집중(attention) 메커니즘을 사용하여 약물 분자에 포함된 원자 정보들을 종합하고, 이를 통해 생성된 분자 임베딩으로 약인성 간손상 유발 가능성을 예측하는 방법을 제안한다. 기존 그래프 기반 방법이 인접 원자들에 대한 높은 의존성으로 효과적인 분자 임베딩을 생성하기 어려웠던 반면, 제안하는 방법은 원자들의 전역적 의존성을 고려함으로써 약인성 간손상을 비교적 효과적으로 예측한다. 이를 증명하기 위해 본 논문의 실험에서는 교차검증과 프리드만 검정을 포함한 정량적 평가와 주의집중 시각화를 포함한 정성적 분석을 통해 제안하는 방법의 유효성을 평가한다.
Authors
- Hyo Jung Cho (ORCID: https://orcid.org/0000-0003-4792-8335)
- Ji Eun Han (ORCID: https://orcid.org/0000-0001-8208-7709)
- Jae Youn Cheong (ORCID: https://orcid.org/0000-0001-6246-1783)
- Charmgil Hong
- Soon Sun Kim (ORCID: https://orcid.org/0000-0002-6862-1896)
- Ye Seul Kim (ORCID: https://orcid.org/0009-0003-2858-4378)
- Harim Kim (ORCID: https://orcid.org/0000-0002-0949-0363)
- Y. S. Sohn
Publication Details
- Journal
- KIISE Transactions on Computing Practices
- Published
- 2024-10-24
- DOI
- https://doi.org/10.5626/ktcp.2024.30.10.506
- Primary Topic
- Drug-Induced Hepatotoxicity and Protection
- Type
- article
- Field-Weighted Citation Impact
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